Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Card11Q8CIS0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms