Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nup88Q8CEC0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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