Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms