Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cxcl16Q8BSU2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cxcl16Q8BSU2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cxcl16Q8BSU2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cxcl16Q8BSU2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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