Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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