Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms