Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shq1Q7TMX5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shq1Q7TMX5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Shq1Q7TMX5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms