Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NipblQ6KCD5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
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NipblQ6KCD5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NipblQ6KCD5 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
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