Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atf3Q60765 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms