Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms