Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37427-201ENSMUST00000192356 906 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gtpbp6Q3U6U5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gtpbp6Q3U6U5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms