Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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