Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Kdm4dQ3U2K5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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