Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm38336-201ENSMUST00000193040 2549 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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