Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.4 ms