Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms