Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nme2Q01768 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms