Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Top2aQ01320 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms