Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PrcdQ00LT2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms