Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gfi1P70338 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms