Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smg6P61406 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms