Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CdaP56389 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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CdaP56389 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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CdaP56389 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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