Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LmnaP48678 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms