Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ItgavP43406 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms