Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtgfrP43117 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms