Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms