Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nedd1P33215 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms