Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
BgnP28653 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
BgnP28653 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BgnP28653 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms