Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fcer1aP20489 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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