Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou5f1P20263 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou5f1P20263 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms