Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P10404 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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P10404 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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P10404 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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P10404 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P10404 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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