Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06344 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P06344 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P06344 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P06344 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P06344 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P06344 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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P06344 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06344 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms