Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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H2-Eb1P04230 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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H2-Eb1P04230 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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