Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm2056J3QQ02 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm2056J3QQ02 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm2056J3QQ02 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm2056J3QQ02 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm2056J3QQ02 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm2056J3QQ02 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm2056J3QQ02 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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