Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf148G3X9R7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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