Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
XntrpcF8VQM8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.5 ms