Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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