Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc8E9PWG2 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc8E9PWG2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms