Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms