Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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