Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms