Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrpxQ9R0M3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms