Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acox1Q9R0H0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acox1Q9R0H0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms