Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd4Q9QY39 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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