Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkp3Q9QY23 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkp3Q9QY23 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms