Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms