Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm2bQ9JME9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vstm2bQ9JME9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vstm2bQ9JME9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vstm2bQ9JME9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm2bQ9JME9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms