Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
AatfQ9JKX4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
AatfQ9JKX4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AatfQ9JKX4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms