Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf13bQ9ET35 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfrsf13bQ9ET35 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf13bQ9ET35 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms