Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cpsf1Q9EPU4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpsf1Q9EPU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cpsf1Q9EPU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms